無管道通風柜和生物安全柜都是專門類型的實驗室設備。雖然化學通風柜和生物安全柜看起來很相似，并且都可以保護實驗室工作人員免受實驗室危害，但它們的目的、功能和操作卻有很大不同。

無管道通風柜旨在清除工作區域中的化學煙霧和氣溶膠，而生物安全柜旨在為在處理傳染性病原體或毒素時產生氣溶膠的員工提供清潔的工作環境和保護。

無管道通風柜可保護用戶，而生物安全柜可保護用戶、環境和材料。生物安全柜有高效微粒空氣 （HEPA）過濾器，而無管道通風柜則沒有。生物安全柜排氣系統中的HEPA過濾器將有效捕獲所有已知的傳染性病原體，并確保只有無微生物的廢氣從柜中排出（即99.97%的直徑為0.3μm的顆粒和99.99%的更大或更小尺寸的顆粒）。

下圖顯示了兩種機柜的氣流設計的基本示例。

下圖描述了無管道通風柜和生物安全柜之間的區別。